Protocolul de colaborare dintre Liceul Teologic Baptist ”Emanuel” și Comunitatea Creștină Baptistă Cluj are următoarele obiective:
Implementarea unor parteneriate, proiecte, programe și activități religioase și educative pentru promovarea în cadrul unor contexte formative a unor modalități specifice pentru cultivarea valorilor morale în viața elevilor în mediul școlar și eclesial;
Valorizarea publică de către cele două instituții a importanței familiei, școlii și bisericii și conștientizarea importanței acestor instituții ca factori modelatori și motivatori fundamentali în cadrul schimbărilor culturale, sociale, al mentalităților, atitudinilor și al valorilor morale;
Creșterea calității comunicării dintre conducerea Comunității Creștine Baptiste Cluj și conducerea Liceului Teologic Baptist „,Emanuel" Cluj-Napoca prin organizarea unor întâlniri de lucru comune și prin informări regulate între cele două instituții;
Promovarea publică în cadrul unității de învățământ a unor lideri creștini baptiști, modele de comportment în sfera asumării de responsabilități în viața personală și publică, care să contribuie la conștientizarea și la motivarea elevilor în formarea și dezvoltarea propriei personalități în spiritul valorilor și moralei creștine.